Iako većina ovih operativnih sistema zahteva da korisnik kupi komercijalnu licencu, postoji nekoliko operativnih sistema izdatih pod drugu vrstu licence, poznate kao GNU javna licenca (GPL).
Komercijalne licence obično negiraju krajnjim korisnicima mogućnost da menjaju program na bilo koji način. Windows 7, Mac OS x i Unix su primeri komercijalnog OS softvera.
Nasuprot tome, GPL dozvoljava krajnjim korisnicima da modifikuju i poboljšaju kod, ako to žele, kako bi bolje odgovarao njihovom okruženju. Neki uobičajeni operativni sistemi, koji su objavljeni pod GPL, uključuju Linux i BSD.